En el año 1576, el rey Felipe II ordenó construir el conjunto de las Torres de los Alfaques para proteger este puerto contra la piratería sarracena. De las cuatro torres previstas se hicieron la del Codonyol y la de San Juan.

La Torre, situada en la población de Pueblo Nuevo del Delta en el municipio de Amposta (Tarragona), es de planta cuadrada de gran tamaño y poca altura, de forma tronco piramidal (peraltada) y paramentos ligeramente convexas. Actualmente sólo queda la parte inferior y maciza de la torre.

Estuvo en funcionamiento durante unos 250 años, con una guarnición de 12 personas, viviendo varios episodios durante la Guerra de los Segadores (1640-1652) y durante la Guerra del Francés (1808-1814), cuando fue probablemente destruida por la armada británica , para romper la línea de comunicación costera del ejército francés, o vuelo por el mismo ejército francés durante la retirada

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